Kütahya'nın kuzeyinde kalan Domaniç ilçesinin çevresinde çok geniş bir alana yayılmış olan Domaniç Ormanları ve Kaşalıç Tabiatı Koruma Alanı'nda, pek çok endemik tür ve anıtsal değerde ağaç bulunmaktadır. Kütahya'nın güneyinde Gediz ilçesine 30 km. uzaklıkta, 2312 m. yükseklikte İç Ege Bölgesi'nin en yüksek dağı olan Murat Dağı da, kestane, meşe ve çam ormanlarından oluşan zengin bir bitki kuşağına sahiptir.
Tavşanlı İlçesi, Vakıf Köyü sınırları içerisinde bulunan, nesli tükenmeye maruz kalmış karaçam, ehrami karaçam ve ebe çamının yurdumuzda yalnızca bir arada bulunduğu Vakıf Çamlığı Tabiatı Koruma Alanı, bitki inceleme açısından oldukça önemli alanlardır.